تعمل أمينة البنداري حاليا كمدرسة غير متفرغة في قسم الحضارات العربية والإسلامية بالجامعة الأمريكية بالقاهرة. حصلت أمينة البنداري على درجة الدكتوراه سنة 2007 من كلية الدراسات الشرقية في جامعة كامبريدج، وكان عنوان رسالتها "وجوه في الزحام: الإحتجاجات في مدن مصر وسوريا في أواخر العصور الوسطى". وقد انضمت إلى المرأة والذاكرة في عام 2004. وهي أيضا عضوة في الجمعية المصرية للدراسات التاريخية. وفي الفترة بين 1999 و 2003 عملت أمينة البنداري في جريدة الأهرام ويكلي حيث كتبت مقالات عديدة حول المشهد الثقافي في مصر والمنطقة العربيةت ضمنت مراجعات لمطبوعات أكاديمية وكتابات إبداعية. وعملت كمساعدة تحرير لملحق الكتاب الشهري بالجريدة وترأست تحرير ملحقات خاصة مثل الملحق حول الذكرى الخمسين لثورة يوليو 1952 وملحق المئوية الثانية لوصول محمد علي باشا إلى السلطة.
وفي عام 2000 حصلت على درجة الماجستير من قسم الدراسات العربية في الجامعة الأمريكية بالقاهرة، وكان عنوان رسالتها "تواريخ البطل المسلم: صورة الظاهر بيبرس في العصرين الوسيط والحديث". وقد حصلت على شهادة بكالوريوس الآداب مع مرتبة الشرف الأولى في العلوم السياسية مع تخصص فرعي في التاريخ الأوروبي من الجامعة الأمريكية بالقاهرة سنة 1996.
وحصلت على منحة ريوتشي ساساكاوا للقادة الشباب من طلبة الدراسات العليا ما بين عامي 1996-1998. و قد منحتها جمعية الباحثين المتخصصين بالشرق الأوسط في العصور الوسطى جائزة أفضل ورقة بحثية ضمن طلبة الدراسات العليا حول موضوع متعلق بالعصر الوسيط عام 1998.وكان عنوان ورقتها البحثية "السلطان, الطاغية والبطل: التغير في صورة الظاهر بيبرس في العصر الوسيط".
وقد قامت بتدريس مادة التاريخ العربي لطلبة شهادة البكالوريوس في الجامعة الأمريكية بالقاهرة. ومنذ 1997 وهي مشاركة في تنظيم سيمنار التاريخ السنوي الذي ينظمه قسم الحضارات العربية والاسلامية في الجامعة الأمريكية بالقاهرة.
وتعمل أمينة البنداري حاليا على كتاب معتمدة على رسالتها للدكتوراه حيث قامت بتحليل ومقارنة وقائع الاحتجاجات الحضرية في المدن المصرية والسورية في أواخر العصر المملوكي وبداية الفترة العثمانية. وتتضمن مؤلفاتها "تأريخ الاحتجاجات في أواخر العصر المملوكي وبداية العصر العثماني في مصر وسوريا",مجلة المعهد الدولي للدراسات الآسيوية 43(ربيع 2007), الأوقاف في سطور وصور مع هدى السعدي. (القاهرة: مؤسسة المرأة والذاكرة,2006), " إدارة الأزمة و الشدة العظمى" في المال والأرض والتجارة: تاريخ اقتصادي للعالم الإسلامي المتوسطي, تحرير نيللي حنا ( لندن ونيويورك: I.B. Tauris, 2002) , "السلطان,الطاغية والبطل: التغير في صورة الظاهر بيبرس في العصر الوسيط",مجلة الدراسات المملوكية 5(2001).